Model Mathematics

Component: environment

Component: Arg

ddtime Arg = k_1 ⁢ Fe3_Arg + k_4 ⁢ Fe2_Arg + S - k1 ⁢ Arg ⁢ Fe3 + k4 ⁢ Arg ⁢ Fe2 S = k1 ⁢ Arg ⁢ Fe3 + k4 ⁢ Arg ⁢ Fe2 - k_1 ⁢ Fe3_Arg + k_4 ⁢ Fe2_Arg

Component: Fe3

ddtime Fe3 = k_1 ⁢ Fe3_Arg + k14 ⁢ Fe3_NO + k13 ⁢ Fe2_NO ⁢ O2 + k8 ⁢ Fe3_NOHA - k1 ⁢ Arg ⁢ Fe3 + k2 ⁢ Fe3 + k_8 ⁢ NOHA ⁢ Fe3

Component: Fe3_Arg

ddtime Fe3_Arg = k1 ⁢ Fe3 ⁢ Arg - k_1 ⁢ Fe3_Arg + k3 ⁢ Fe3_Arg

Component: Fe2

ddtime Fe2 = k2 ⁢ Fe3 + k_4 ⁢ Fe2_Arg + k9 ⁢ Fe2_NOHA - k4 ⁢ Fe2 ⁢ Arg + k_9 ⁢ Fe2 ⁢ NOHA

Component: Fe2_Arg

ddtime Fe2_Arg = k3 ⁢ Fe3_Arg + k_5 ⁢ Fe3_O2_Arg + k4 ⁢ Fe2 ⁢ Arg - k5 ⁢ Fe2_Arg ⁢ O2 + k_4 ⁢ Fe2_Arg

Component: Fe3_O2_Arg

ddtime Fe3_O2_Arg = k5 ⁢ Fe2_Arg ⁢ O2 - k6 ⁢ Fe3_O2_Arg + k_5 ⁢ Fe3_O2_Arg

Component: Fe3_NOHA

ddtime Fe3_NOHA = k6 ⁢ Fe3_O2_Arg + k_8 ⁢ Fe3 ⁢ NOHA - k7 ⁢ Fe3_NOHA + k8 ⁢ Fe3_NOHA

Component: Fe2_NOHA

ddtime Fe2_NOHA = k7 ⁢ Fe3_NOHA + k_10 ⁢ Fe3_O2_NOHA + k_9 ⁢ Fe2 ⁢ NOHA - k9 ⁢ Fe2_NOHA + k10 ⁢ Fe2_NOHA ⁢ O2

Component: Fe3_O2_NOHA

ddtime Fe3_O2_NOHA = k10 ⁢ Fe2_NOHA ⁢ O2 - k11 ⁢ Fe3_O2_NOHA + k_10 ⁢ Fe3_O2_NOHA

Component: Fe3_NO

ddtime Fe3_NO = k11 ⁢ Fe3_O2_NOHA - k14 ⁢ Fe3_NO + k12 ⁢ Fe3_NO

Component: Fe2_NO

ddtime Fe2_NO = k12 ⁢ Fe3_NO - k13 ⁢ Fe2_NO ⁢ O2

Component: NO

ddtime NO = k14 ⁢ Fe3_NO dNOdt=k14⁢Fe3_NO

Component: citrulline

ddtime citrulline = k11 ⁢ Fe3_O2_NOHA

Component: NO3

ddtime NO3 = k13 ⁢ Fe2_NO ⁢ O2

Component: NOHA

ddtime NOHA = k8 ⁢ Fe3_NOHA + k9 ⁢ Fe2_NOHA - k_8 ⁢ Fe3 ⁢ NOHA + k_9 ⁢ Fe2 ⁢ NOHA

Component: model_constants